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Das Atrium befindet sich gleich im Eingangsbereich der Casa Aemilia und ist der repräsentativste Raum der Casa. Es ist vor allem der zentraler Aufenthaltsraum der Bewohner der Casa, dient aber auch dem Empfang von Gästen der Aemilier. Durch die typische Dachöffnung ist er trotz zentraler Lage am Tag lichtdurchflutet und in der Nacht von Mond und Sternen beschienen. In der Mitte des Raumes und direkt unter der Dachöffnung befindet sich ein großes Auffangbecken für Regenwasser, um das immer ein paar Klinen platziert sind.