Einst war Vesontio der Hauptort der Sequaner, ein keltischer Volksstamm im Osten Galliens.
Die Sequaner hatten in ihrem Streben nach Suprematie den Germanenfürst (der Sueben) Ariovist in Dienst genommen. Dann verloren sie die Kontrolle über ihn. Er siedelt Germanen in ihrem Gebiet an. 59 war er zum amicus populi Romani erklärt worden, bevor die Helvetier durch seinen Druck auswandern. Nach dem Sieg über die Helvetier ging Caesar von allen Galliern zu Hilfe gerufen auf Konfrontationskurs: durch die Eroberung von Vesontio verschafft er sich einen strategischen Vorteil und schlägt Ariovist im Herbst 58.
Vesontio, wie wir Römer die Stadt nennen, wird von einer
Berghöhe abgeriegelt, und zwar so dicht, daß der Fluß an beiden Seiten direkt das Gebirge umspült “ schrieb Caesar im „Gallischen Krieg“. Wir Römer bauten die erste Festung auf dem Berg in der engen Schleife des Doubs.
Im Mai 68 schlug die Rheinarmee bei Vesontio den Aufstand des Iulius Vindex nieder. Der Anstifter beging Selbstmord. Nun versuchten die siegreichen Legionäre ihren Kommandanten Verginius Rufus zum Kaiser auszurufen. Doch dieser lehnte die Würde ab.
Die beiden Duumvirn der Stadt sind Gaius Fundanius Fundulus und der hochnäsige Aulus Postumius Albinus.